Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3lQ4KL14 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms