Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc114Q3UX62 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms