Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnga4Q3UW12 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms