Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr1d1Q3UV55 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms