Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gm29609Q3UU56 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm29609Q3UU56 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm29609Q3UU56 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm29609Q3UU56 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm29609Q3UU56 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm29609Q3UU56 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm29609Q3UU56 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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