Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrch2Q3UMG5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrch2Q3UMG5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms