Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsg1Q3UM18 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsg1Q3UM18 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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