Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trafd1Q3UDK1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms