Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms