Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssbp4Q3U4B1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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