Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Rnf149Q3U2C5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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Rnf149Q3U2C5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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