Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms