Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc102aQ3TMW1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms