Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc127Q3TC33 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms