Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pi4k2aQ2TBE6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pi4k2aQ2TBE6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms