Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms