Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms