Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Samd12Q0VE29 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd12Q0VE29 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms