Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps8Q0P5W1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms