Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NeblQ0II04 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NeblQ0II04 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms