Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700061G19RikQ08EE8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700061G19RikQ08EE8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms