Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cnn1Q08091 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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