Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfiaQ02780 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms