Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjb4Q02738 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms