Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms