Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoa1Q00623 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms