Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IhhP97812 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IhhP97812 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IhhP97812 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IhhP97812 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IhhP97812 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IhhP97812 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IhhP97812 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IhhP97812 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IhhP97812 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IhhP97812 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IhhP97812 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IhhP97812 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IhhP97812 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IhhP97812 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IhhP97812 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IhhP97812 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IhhP97812 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IhhP97812 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IhhP97812 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IhhP97812 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IhhP97812 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IhhP97812 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IhhP97812 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IhhP97812 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IhhP97812 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms