Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tarbp2P97473 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms