Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nbr1P97432 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nbr1P97432 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms