Protein–RNA interactions for Protein: P97343

Uhmk1, Serine/threonine-protein kinase Kist, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhmk1P97343 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhmk1P97343 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms