Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms