Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53bp1P70399 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms