Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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