Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad1P70340 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms