Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp7P70280 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp7P70280 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms