Protein–RNA interactions for Protein: P63137

Gabrb2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb2P63137 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb2P63137 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb2P63137 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms