Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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