Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chp1P61022 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chp1P61022 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chp1P61022 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chp1P61022 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chp1P61022 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chp1P61022 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chp1P61022 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms