Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms