Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrlP54846 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrlP54846 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrlP54846 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrlP54846 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrlP54846 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms