Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Lbx1P52955 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Lbx1P52955 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lbx1P52955 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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