Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms