Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FmodP50608 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FmodP50608 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FmodP50608 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FmodP50608 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FmodP50608 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FmodP50608 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms