Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TubP50586 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TubP50586 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TubP50586 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TubP50586 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TubP50586 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TubP50586 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TubP50586 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TubP50586 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TubP50586 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TubP50586 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms