Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp3P49194 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms