Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ItgavP43406 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ItgavP43406 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ItgavP43406 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ItgavP43406 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms