Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtgfrP43117 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtgfrP43117 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms