Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms