Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fen1P39749 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms