Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms